In una baraccopoli di immigrati clandestini messicani,
una ragazza di nome Maria Dorantes, dopo aver salutato il suo ragazzo
Soledad Buente, viene corteggiata da Eladio, il fratello del ragazzo.
Distratta, Maria si è lasciata sfuggire tre capre che segue dietro
una collinetta, a sua volta seguita da Eladio. All'improvviso, tutto
il villaggio viene illuminato da un lampo a cui fa seguito una strana
pioggia sulfurea. Poco dopo Maria ed una capretta vengono ritrovate
morte col viso e gli occhi divorati. Secondo Fox le mutilazioni assomigliano
a quelle di tipo alieno e gli eventi atmosferici forteani sono da ricollegare
ad un fenomeno detto transiente, che spesso precede gli avvistamenti
di UFO. Scully è molto scettica, sia di fronte a questa spiegazione,
che a quella di Flakita, una vicina di Maria, che accusa della morte
della ragazza il chupacabra: il divoratore di capre. Soledad non ha
dubbi, il colpevole è suo fratello, geloso della ragazza, e l'acqua
ed il tuono altro non sono che trucchi. Mentre Fox va alla ricerca di
Eladio, Dana si dirige in ospedale per i risultati dell'autopsia e scopre
inorridita che la ragazza è morta in seguito ad una devastante
infezione di un fungo comune, rivelatosi letale su un soggetto con immunodeficienze
provocate da un forte pesticida. In prigione Fox rintraccia, grazie
al cinico agente dell'immigrazione Conrad Lozano, Eladio che si dichiara
innocente e asserisce di essere svenuto accecato dal lampo. Al suo risveglio,
Maria era morta e deturpata. Durante il trasferimento oltre confine,
accade quello che era gia accaduto in cella: tutti i prigionieri vogliono
stare lontani da Eladio ritenendolo il Chupacabra. Questo costringe
l'autista a trasferirlo vicino al posto di guida e poco dopo, lo stesso
autista viene ritrovato morto a causa di uno shock anafilattico dovuto
ad un altro tipo di fungo. I due agenti decidono di seguire strade diverse
e, mentre Dana cerca di capire la causa di queste morti, Fox e Conrad
si danno alla ricerca di Eladio che, disperato, cerca di ritornare in
Messico, rivolgendosi allo stesso barbiere che lo aveva fatto entrare
clandestinamente in America. Alla ricerca del denaro necessario, raggiunge
una piazza dove si ritrovano i clandestini in cerca di un'occupazione
giornaliera. Dinanzi a lui tutti si scansano e viene caricato da un
americano che ha bisogno di un manovale per la costruzione della sua
casa. Intanto Dana scopre che la causa dei decessi è dovuta ad
un enzima sconosciuto che catalizza la proliferazione di funghi altresì
innocui. Eladio viene ritrovato dal fratello, ma riesce a fuggire non
prima di aver provocato, involontariamente, la morte del suo datore
di lavoro. Il ragazzo raggiunge la cugina Gabrielle in cerca di aiuto
e dei soldi necessari ma non ne ricava granché. Dana e Fox confrontano
le proprie teorie, ma se per Scully, Eladio uccide diffondendo l'enzima,
al contrario Fox ritiene che il lampo caduto durante la morte di Maria
sia stato causato da un bolide, un frammento di meteorite entrato nella
nostra atmosfera, al cui interno si trovava un enzima alieno. Il barbiere
che dovrebbe riportarlo in Messico racconta a Fox e Conrad dove possono
trovare Eladio, ma questi sfugge al tentativo di arresto e, pieno di
pustole e con una carnagione bianca, entra in un supermercato per rubare
da mangiare. Scoperto da un commesso, viene messo in fuga, non prima
di aver involontariamente contaminato il reparto dei dolciumi. Chiama
Gabrielle per l'appuntamento, viene a sapere che ha raccontato a Soledad
dove trovarlo. Soledad viene arrestato da Lozano ed i due agenti mentre,
pistola in pugno, aveva fatto irruzione nel supermercato in cerca di
vendetta. Al loro fianco, il commesso completamente divorato da un mare
di muffa sulfurea. Eladio va da Gabrielle, ma ha ormai assunto un aspetto
orribile tanto da indurre la cugina a chiamarlo chupacabra. La polizia
ritorna da Gabrielle che ribadisce che Eladio è fuggito in Messico,
ma secondo Fox, lui sta cercando il fratello arrestato. Flakita racconta
che durante la resa dei conti tra i due fratelli, l'agente Lozano era
stato ucciso ed altri chupacabra avevano preso Eladio per portarlo via.
Agli immigrati, invece, Gabrielle racconta che Conrad aveva liberato
Soledad per far risolvere la questione tra i due uomini, ma Soledad
era stato incapace di freddare suo fratello e nella colluttazione successiva
aveva accidentalmente ucciso l'agente dell'immigrazione. E Dio aveva
punito Soledad trasformando anche lui in un chupacabra.Skinner è
molto confuso del rapporto dei suoi agenti, perché i presunti
alieni visti da Flakita, altri non erano che agenti in tuta batteriologica
che cercavano di isolare i portatori sani di questo misterioso enzima,
ma senza loro, nessuna conclusione poteva essere tratta. I due fratelli,
ormai con il capo completamente deforme, camminano lungo una strada
chiedendo inutilmente un passaggio, invisibili ai più.